医療費控除とセルフメディケーション税制はどっちが得？違い・併用・計算例をわかりやすく【2026年版】
2026年11月7日更新
・医療費控除とセルフメディケーション税制は、どっちが得なの？
・2つの制度の違いは？両方使える（併用できる）の？
・どうやって申告するの？
こんな疑問にお答えします。
本記事の内容
・医療費控除とセルフメディケーション税制のしくみと違い
・どっちが得かがわかる計算例
・申告のしかたと、2027年からの変更点
国税庁と厚生労働省の情報をもとに、健康管理士の筆者が解説します。
こんにちは！たかの健康講座の管理人です。
病院や薬にお金がかかった年は、確定申告で税金が少なくなることがあります。そのための制度が、「医療費控除」と「セルフメディケーション税制」の2つです。
「名前は聞いたことがあるけど、どっちを使えばいいの？」「両方使えるの？」と迷う方も多いのではないでしょうか。
この記事では、2つの制度の違いと、どっちが得かの考え方を、国税庁と厚生労働省の情報をもとにまとめます（2026年11月時点）。
結論｜どっちが得かは「1年間の医療費」と「市販薬の金額」で決まる。併用はできない
結論から言うと、2つの制度は、どちらか一方しか使えません。セルフメディケーション税制は「医療費控除の特例」で、通常の医療費控除との選択になるからです。
どっちが得かは、控除できる金額（控除額）が大きいほうです。目安は次のとおりです。
- 病院・歯医者などの医療費が多い年（1年で10万円をこえる）：通常の医療費控除が得になりやすい
- 病院にはあまり行かず、市販薬をよく買った年：セルフメディケーション税制が得になりやすい（対象の市販薬が1万2千円をこえた分）
- 迷ったら：両方の控除額を計算して、大きいほうを選ぶ
なお、一度申告したあとは、更正の請求や修正申告で、もう一方の制度に変えることはできません。申告する前にしっかり比べておきましょう。
医療費控除とは｜1年間の医療費が10万円をこえた分を差し引ける
医療費控除は、1月1日から12月31日までの1年間に支払った医療費が、一定の金額をこえたときに、その分を所得から差し引ける制度です。
国税庁の説明では、控除額は次の式で計算します（最高200万円）。
- 実際に支払った医療費の合計
- － 保険金などで補てんされる金額（入院給付金・高額療養費・出産育児一時金など）
- － 10万円（その年の総所得金額等が200万円未満の人は、総所得金額等の5%）
ポイントは次の3つです。
- 家族の分もまとめられる：自分と「生計を一にする」配偶者や親族のために払った医療費も合わせて計算できます
- 治療のための市販薬も入る：かぜをひいたときのかぜ薬など、治療のための薬の代金は医療費になります。ビタミン剤など、予防や健康づくりのための薬は入りません
- 通院の交通費も入る：電車やバスの運賃は入ります。タクシー代は、公共交通機関が使えない場合をのぞいて入りません。自家用車のガソリン代や駐車場代は入りません
反対に、健康診断の費用は、原則として医療費控除の対象になりません。また、本人や家族の都合だけで個室に入ったときの差額ベッド代も対象外です。
かぜをひいたときの過ごし方は、こちらの記事で書いています。
》風邪を早く治す方法｜健康管理士が教える5つの過ごし方と受診の目安
セルフメディケーション税制とは｜対象の市販薬が1万2千円をこえた分を差し引ける
セルフメディケーション税制は、健康診断や予防接種などの「一定の取組」をしている人が、対象の市販薬（OTC医薬品）を1年間に1万2千円をこえて買ったときに、こえた分を所得から差し引ける制度です。控除額の上限は8万8千円です。
- 対象の市販薬の購入費の合計（保険金などで補てんされる分をのぞく）
- － 1万2千円
- ＝ 控除額（最高8万8千円）
対象の市販薬の見分け方
対象になるのは、医師が処方する薬から市販薬に切りかわった「スイッチOTC医薬品」などです。かぜ薬・解熱鎮痛薬・せき止め・鼻炎薬・アレルギー用薬などのうち、決められた成分を含むものが対象です。
対象の薬は、次の方法で見分けられます。
- パッケージに「セルフメディケーション 税 控除対象」の共通識別マークがついている（ついていない商品もあります）
- 薬局・ドラッグストアのレシートに「★」などの印と、「★印は税制対象品目」などの説明が書かれている
- 厚生労働省のホームページに、対象の成分や品目の一覧がのっている（原則、毎月1日に更新）
申告にはレシートの記載がたよりになるので、市販薬のレシートは捨てずにとっておくのがおすすめです。
「一定の取組」とは｜健康診断・予防接種など
セルフメディケーション税制を使うには、申告する年に、申告する本人が次のどれか1つを受けている必要があります。
- 健康保険組合・市区町村の国保などの保険者が行う健康診査（人間ドックなど）
- 市区町村が健康増進事業として行う健康診査（歯周疾患検診・骨粗鬆症検診など）
- 予防接種（定期接種、インフルエンザワクチンの予防接種）
- 勤務先で行う定期健康診断
- 特定健康診査（メタボ健診）、特定保健指導
- 市町村が健康増進事業として行うがん検診（胃・子宮頸・肺・乳・大腸の5つ）
注意したいのは、次の点です。
- 子どもが予防接種を受けても、申告する本人が受けていなければ使えません（薬代は家族の分も合わせられます）
- 全額自己負担で、自分で申し込んだ健康診査は、原則として「一定の取組」になりません
- 健康診断や予防接種の費用そのものは、控除の対象になりません
健康診断の結果の見方は、こちらの記事で書いています。
》健康診断を見るとき気をつけるべきこと
医療費控除とセルフメディケーション税制の違い
2つの制度の違いを表にまとめます（2026年11月時点）。
| 医療費控除 | セルフメディケーション税制 | |
|---|---|---|
| 対象 | 病院・歯科の治療費、治療のための薬代、通院の交通費など | 対象の市販薬（スイッチOTC医薬品など）の購入費 |
| 差し引く金額（下限） | 10万円（総所得金額等が200万円未満なら、その5%） | 1万2千円 |
| 控除額の上限 | 200万円 | 8万8千円 |
| 条件 | 特になし | 本人が健康診断・予防接種などの「一定の取組」をしている |
| 家族の分 | 生計を一にする家族の分も合算できる | 生計を一にする家族の分も合算できる |
| 申告に必要なもの | 確定申告書・医療費控除の明細書 | 確定申告書・セルフメディケーション税制の明細書 |
大きな違いは、差し引く金額（10万円か1万2千円か）と、健康診断などの条件があるかどうかです。
どっちが得？計算例で比べてみる
ここでは、総所得金額等が200万円以上の人で、保険金などの補てんがない場合の例で比べます。対象の市販薬は、かぜ薬など治療のための薬なので、通常の医療費控除にも入れて計算します。
例1｜病院代3万円・対象の市販薬2万円の場合
- 通常の医療費控除：3万円＋2万円＝5万円。10万円をこえないので、控除額は0円
- セルフメディケーション税制：2万円－1万2千円＝控除額8,000円
→ セルフメディケーション税制が得です（健康診断などを受けていることが条件）。
例2｜病院・歯医者代15万円・対象の市販薬2万円の場合
- 通常の医療費控除：15万円＋2万円－10万円＝控除額7万円
- セルフメディケーション税制：2万円－1万2千円＝控除額8,000円
→ 通常の医療費控除が得です。
控除額がそのまま戻ってくるわけではない
勘違いしやすいのですが、控除額は「所得から差し引ける金額」で、そのまま戻ってくるお金ではありません。少なくなる税金は、控除額に税率をかけた分です。
たとえば、所得税の税率が5%の人で控除額が8,000円なら、所得税は400円ほど少なくなります（このほか、住民税も少なくなります）。
そのため、控除額が小さいときは、レシートを集めて申告する手間と比べて考えるのもよいでしょう。
申告のしかたと注意点｜2027年からの変更も
確定申告で申告する
どちらの制度も、確定申告書に明細書をつけて、税務署に申告します。会社員の方も、会社の年末調整ではなく、自分で確定申告をする手続きです。
- 確定申告の期間は、例年2月中旬から3月中旬ごろです
- 確定申告をする必要がない人（税金を返してもらうための還付申告）は、その年の翌年1月1日から5年間、申告できます
- 領収書やレシートは、申告書にはつけません。ただし、確定申告期限などから5年間は、税務署から見せるよう求められることがあるので、保管しておきます
- セルフメディケーション税制の「一定の取組」の証明（健康診断の結果通知表や予防接種の領収書など）も、申告書にはつけなくてよくなっています。こちらも保管しておきます
- 医療費控除では、健康保険の「医療費通知」をつけると、明細書の記入を簡単にできます
同じ世帯の中で、ある人は医療費控除、別の人はセルフメディケーション税制で申告することもできます。ただし、同じ医療費を重ねて控除することはできません。
2027年（令和9年）からの変更点
令和8年度の税制改正で、セルフメディケーション税制は次のように見直されました（厚生労働省の通知より）。
- 期限：スイッチOTC医薬品は期限がなくなり（恒久化）、それ以外の薬は令和13年（2031年）12月31日まで5年延長
- 対象の追加（2027年1月1日から）：胃腸薬・便秘薬（瀉下薬）・浣腸薬・痔の薬・生薬のせき止めなどが対象に加わる
- 検査キットの追加（2027年1月1日から）：排卵日予測検査薬、新型コロナウイルスの抗原検査キット、新型コロナ／インフルエンザの抗原検査キット
- 対象から外れるもの：痩身・美容目的で使われる可能性があるとして、防風通聖散・大柴胡湯の薬が対象外に（防風通聖散は2030年12月31日までは対象）
このほか、2026年1月1日から、L-アスパラギン酸カルシウム・フッ化ナトリウム・メコバラミン・ユビデカレノンを含むスイッチOTC医薬品は対象外になっています。
2027年1月1日以後は、パッケージのマークの切りかえがしばらく続くため、レシートの表示で確かめるよう厚生労働省が呼びかけています。対象の薬は変わることがあるので、申告の前に厚生労働省や国税庁のホームページで確かめてください。
よくある質問
Q. 医療費控除とセルフメディケーション税制は併用できますか？
できません。どちらか一方を選んで申告します。申告したあとに、もう一方へ変えることもできません。
Q. 家族の分の市販薬もまとめられますか？
はい。自分と生計を一にする配偶者や親族のために買った対象の市販薬も合わせられます。ただし、健康診断や予防接種などの「一定の取組」は、申告する本人が受けている必要があります。
Q. セールで安く買った市販薬は、いくらで計算しますか？
割引後に実際に支払った金額（税込み）で計算します。
Q. ネット通販で買った市販薬も対象になりますか？
対象の薬であれば対象です。ただし、自宅のプリンタで印刷した領収書は、証明書類の原本として認められないとされています。通販の会社に証明書類の発行を頼みましょう。
Q. レシートをなくしてしまいました
セルフメディケーション税制には、対象の薬であることがわかる領収書が必要です。買ったお店に、レシートの再発行ができないか相談してみてください。
まとめ
- 医療費控除とセルフメディケーション税制は併用できない。控除額が大きいほうを選ぶ
- 医療費控除：1年間の医療費が10万円（所得200万円未満なら所得の5%）をこえた分。上限200万円
- セルフメディケーション税制：対象の市販薬が1万2千円をこえた分。上限8万8千円。本人が健康診断や予防接種を受けていることが条件
- 病院代が多い年は医療費控除、市販薬が中心の年はセルフメディケーション税制が得になりやすい
- どちらも確定申告で申告する。レシートや健診の書類は5年間保管する
- 2027年1月から、セルフメディケーション税制の対象に胃腸薬や検査キットなどが加わる
制度の内容は変わることがあります。申告するときは、国税庁や厚生労働省のホームページで最新の情報を確かめてください。
病院代や薬代を減らすいちばんの近道は、ふだんから健康でいることです。健康寿命については、こちらの記事で書いています。
》健康寿命を延ばすメリットとは？平均寿命との違い・差と、延ばすためにできること
この記事があなたの役に一つでもなれば幸いです。
最後までお読みいただきありがとうございました。
みらい
ウェブマーケティング・ウェブサイト運営歴15年以上
ウェブ関連企業で勤務経験
ウェブ制作・IT系担当
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